一、农业防治。1、适期播种。一般以5厘米地温稳定在12～15℃时开始播种为宜。2、严格选用无病菌新土配营养土育苗。3、实行轮作。与禾本科作物轮作可减轻发病。4、秋耕冬灌。瓜田秋季深翻25～30厘米，将表土病菌和病残体翻入土壤深层腐烂分解。5、加强田间管理。出苗后及时剔除病苗。雨后应中耕破除板结，以提高地温，松疏土壤，增强瓜苗抗病力。
二、药剂防治。1、药剂浸种，使用新高脂膜进行浸种，每瓶新高脂膜母液一般稀释5-10公斤液体，浸种后捞出晾干即可下种。可保温、保湿、吸胀，提高种子发芽率，使幼苗健壮。驱避地下虫害，隔离病毒感染。也可与种衣剂混用。2、发病初期可用针对性杀菌剂配合新高脂膜500倍液进行喷施防治，隔绝病菌侵染，提高抗自然灾害能力和光合作用强度，保护甜瓜茁壮成长。