夏季气温高、雨水多、湿度大，连年重茬、密度过大、氮肥施用过多，都会引起该病的发生和流行。苗期发病造成缺株，成株期发病叶片黑斑，结果期发病引起果实腐烂，防治不及时会给菜农造成严重损失。因此，对褐纹病一定要做到早防、早治。
其防治方法如下：
播种时每平方米用50%多菌灵可湿性粉剂10克，50%福美双可湿性粉剂10克，混合后拌细土2公斤制成药土，取1/3撒在畦面上播种，然后将剩下的药土覆盖在种子上面。
苗期发病，可喷施50%克菌丹500倍液，或60%福美锌500倍液。定植后可在茎基部撒施草木灰或石灰粉杀菌。结果期可喷施40%福星5000～6000倍液，或80%新万生可湿性粉剂500～800倍液，每隔7～10天喷1次，连喷2～3次。为防止产生抗药性，以上农药可交替使用。