金丝瓜病虫害主要有蚜虫、白粉病、霜露病、疫病和炭疽病。在定植后用甲霜灵和多菌灵各500倍作定根水浇施，防治霜霉病和疫病；在插竹后，结合整枝再喷一次甲霜灵和多菌灵各500倍；初次采收后喷一次粉锈宁800～1000倍液防治白粉病。蚜虫可用乐果800倍液加敌杀死1000倍液混合喷雾。