一、不宜与碱性肥料混施或同施
尿素不能与石灰、草木灰、钙镁磷肥等碱性肥料混施或同时施用。一般来说，夏秋季节，尿素与碱性肥料应错开3～4天施用，冬春季应错开7～8天。
二、不宜作拌种肥尿素
在生产过程中产生少量缩二脲，当缩二脲含量超过2％时就会对种子和幼苗产生毒害，影响种子发芽和幼苗生长。
三、不宜施后马上灌水
如果施后马上灌水或旱地在大雨前施用，尿素就会溶解在水中而流失。一般夏秋季节应在施后2～3天才能灌水，冬春季节应在施后7～8天灌水。
四、不宜地表撒施
尿素常温需4～5天转化才能被利用。若撒施在地表，大部分在氨化过程中挥发掉，实际利用率只有30％左右。如果在碱性土壤和有机质含量高的土壤中撒施，氮素损失会更快。尿素深施有利于肥效的发挥。
五、不宜施用过迟
施用尿素过晚不利于肥效的发挥，易造成作物贪青晚熟，故一般应比其他氮肥早施4～7天。